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中甸犏牛SLC11A1基因3'非翻译区多态位点研究及其与抗病性关联的评估
作者: 王利平 [1] 席冬梅 [2] 熊和丽 [2] 李国治 [2] 李鹏 [3] 邓卫东 [2]
关键词: SLC11A1基因 中甸犏牛 3& 39;UTR 微卫星多态性(GT)n
摘要：为研究中甸犏牛溶质载体转运蛋白基因(SLC11A1)的结构变异情况,并评估结构变异与抗病性的关联,采集了114个样品,扩增了SLC11A1基因3'非翻译区(3'UTR)部分序列,测序共检测到3个微卫星多态位点(MS1、MS2、MS3)和3个核苷酸变异(1782位点T→G、1805位点G→A、1907位点G→T),其中MS1有6个等位基因(GT10、GT12、GT14—17)、MS2有3个等位基因(GT5—7)、MS3有5个等位基因(GT12—16).GT12/15、GT5/5、GT13/13基因型频率最高,分别为0.204、0.05、0.324;GT15、GT5、GT13等位基因频率最高分别为0.284、0.685、0.433.对MS1、MS2、MS3这3个多态位点进行单倍型分析,发现了44种单倍型,其中GT12/5/13为优势单倍型,频率为0.13.χ2比较分析表明,中甸犏牛与婆罗门瘤牛 × 布兰科牛、荷斯坦牛 × 布兰科牛、布兰科牛、非洲牛MS1位点的GT12/12基因型频率差异显著(P<0.01),与西班牙黄牛、荷兰黄牛MS3的GT13/13基因型频率差异显著(P<0.01),与非洲黄牛差异不显著(P>0.05).综上,中甸犏牛SLC11A1基因3'UTR具有丰富的多态性,推断其GT12/12和GT13/13纯合子基因型与抗病性相关.
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